Sau khi nhấn vào Compare, bạn thấy ba cửa sổ: một hiển thị thân điều khiển Control Body, một hiển thị thân mẫu Sample Body và một hiển thị lớp phủ Overlay của cả hai thân. Cửa sổ Overlay hiển thị các thay đổi trong màu sắc theo thiết lập của bạn. Ví dụ: màu đỏ có nghĩa là vắng mặt (thành phần tồn tại trong thân điều khiển Control Body nhưng không tồn tại trong thân mẫu Sample Body), màu xanh lá cây có nghĩa là mới (thành phần tồn tại trong thân mẫu Sample Body nhưng không tồn tại trong thân điều khiển Control Body) và màu vàng có nghĩa là thay đổi (thành phần tồn tại trong cả hai thân nhưng có hình dạng hoặc vị trí khác nhau).

Bạn có thể sử dụng thanh trượt ở cuối cửa sổ Overlay để làm mờ dần giữa thân điều khiển và thân mẫu và xem chúng khác nhau như thế nào. Bạn cũng có thể xoay, zoom và pan trong bất kỳ cửa sổ nào để xem thay đổi gần hơn.